国家遥感中心绵阳科技城分部在国家遥感中心的领导下，按照《国家遥感中心业务部管理办法》相关要求进行组织。本分部实行依托单位和国家遥感中心领导下的主任负责制，分部主任由依托单位委任，报国家遥感中心备案。业务部人事和机构变更应及时向国家遥感中心备案。按照“小核心、大网络”和“共建共享、责权一致”的运行机制运行。

分部运行机构设主任1名，副主任3名（含常务副主任1名），联系人1名，信息员1名。分部主任由学校校领导担任，全面负责中心建设与发展、人员招聘、经费管理等日常运行管理事宜。常务副主任在主任领导下主持分部日常工作，负责中心科研、人事、财务、资产、设备、共建共享、人才培养、国际合作交流等管理，并定期向主任汇报。

分部设立管理委员会和技术委员会。管理委员会由申报单位的领导组成，对分部的工作进行宏观指导。技术委员会由遥感、地理信息及空间信息科学领域行业的专家组成，其主要职责是：为分部工作提供技术支撑，审议分部研究开发规划和实施计划、评审技术专项、提供技术经济管理咨询等。技术委员会每年组织召开分部学术年会1次，不定期组织专家对分部和各研究方向团队进行现场指导与评估。分部设综合办公室，具体执行日常工作任务，包括科研人事管理、工作报告、文档收集整理以及科技成果转化等。

分部设有研究机构、支撑平台、应用示范平台等，并和相关机构开展合作交流，其组织结构如图所示。